Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLF9Q13886 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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