Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LAMB3Q13751 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms