Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TUBA3CQ13748 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TUBA3CQ13748 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TUBA3CQ13748 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TUBA3CQ13748 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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TUBA3CQ13748 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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TUBA3CQ13748 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TUBA3CQ13748 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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