Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ATP1A4Q13733 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ATP1A4Q13733 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ATP1A4Q13733 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP1A4Q13733 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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