Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TUBB3Q13509 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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