Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SP140Q13342 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SP140Q13342 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SP140Q13342 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SP140Q13342 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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SP140Q13342 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SP140Q13342 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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SP140Q13342 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SP140Q13342 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SP140Q13342 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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