Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN2BQ13224 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN2BQ13224 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
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