Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM32Q13049 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms