Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STRN3Q13033 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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