Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PRDM2Q13029 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRDM2Q13029 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
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