Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSTF3Q12996 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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