Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NPRL3Q12980 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms