Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ANK3Q12955 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ANK3Q12955 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms