Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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PTPRJQ12913 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRJQ12913 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRJQ12913 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRJQ12913 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRJQ12913 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRJQ12913 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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