Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SNTB2-206ENST00000528525 448 ntTSL 37.37□□□□□ -1.233e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 RNF44-207ENST00000513029 1647 ntTSL 217.61■□□□□ 0.417e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 RNF44-204ENST00000506378 848 ntTSL 217.24■□□□□ 0.357e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 RNF44-205ENST00000508478 662 ntTSL 316.14■□□□□ 0.177e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.314e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.792e-18■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 319.52■□□□□ 0.722e-18■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.852e-18■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 KIF2A-204ENST00000504883 783 ntTSL 28.99□□□□□ -0.972e-18■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 KIF2A-210ENST00000514082 874 ntTSL 1 (best)6.51□□□□□ -1.372e-18■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.592e-18■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.634e-8■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.191e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.131e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 PCM1-221ENST00000524203 401 ntTSL 36.36□□□□□ -1.391e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 PCM1-215ENST00000522275 2379 ntTSL 24.58□□□□□ -1.681e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 PCM1-213ENST00000519802 796 ntTSL 24.32□□□□□ -1.721e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 PCM1-208ENST00000518877 316 ntTSL 32.91□□□□□ -1.941e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -21e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 FCGRT-207ENST00000595677 714 ntTSL 514.62□□□□□ -0.076e-8■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 INTS11-227ENST00000525603 738 ntTSL 314.36□□□□□ -0.111e-11■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.93e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 HNRNPM-208ENST00000597270 1147 ntTSL 220.29■□□□□ 0.843e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 519.09■□□□□ 0.653e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 218.48■□□□□ 0.553e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.393e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 517.47■□□□□ 0.393e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.243e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CDK12-206ENST00000581593 559 ntTSL 33.85□□□□□ -1.796e-7■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERS4-203ENST00000558268 713 ntTSL 325.04■■□□□ 1.61e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.021e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.861e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERS4-213ENST00000561053 768 ntTSL 519.36■□□□□ 0.691e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERS4-214ENST00000595722 1826 ntTSL 1 (best)19.2■□□□□ 0.661e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.581e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERS4-206ENST00000558501 873 ntTSL 517.69■□□□□ 0.421e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERS4-211ENST00000560412 568 ntTSL 417.03■□□□□ 0.321e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 CERS4-212ENST00000561008 531 ntTSL 415.32■□□□□ 0.041e-6■■□□□ 13.6
ILF3Q12906 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.416e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.086e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.636e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.454e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.514e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.934e-10■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 SOCS7-203ENST00000617360 2051 ntTSL 516.82■□□□□ 0.284e-10■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.254e-10■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 SOCS7-204ENST00000617765 480 ntTSL 515.5■□□□□ 0.074e-10■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 CLCC1-207ENST00000369976 2468 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.514e-10■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 AL449266.1-201ENST00000357393 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.544e-10■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.314e-10■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 PFKP-210ENST00000468050 425 ntTSL 315.27■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 PFKP-209ENST00000460445 552 ntTSL 513.7□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 PFKP-206ENST00000415005 1140 ntTSL 213.56□□□□□ -0.242e-6■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.754e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 GPR157-203ENST00000466131 458 ntTSL 214.65□□□□□ -0.064e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 AGFG2-204ENST00000474713 1864 ntTSL 516.91■□□□□ 0.31e-6■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 AC087380.1-204ENST00000418729 1026 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.458e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.748e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.818e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.938e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 AC087380.1-201ENST00000420465 1001 ntTSL 37.34□□□□□ -1.238e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.48e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 AC087380.1-203ENST00000420726 752 ntTSL 55.88□□□□□ -1.478e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 55.38□□□□□ -1.558e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 YARS-207ENST00000481895 1018 ntTSL 519.97■□□□□ 0.798e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.078e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 YARS-202ENST00000466052 728 ntTSL 310.25□□□□□ -0.778e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 YARS-210ENST00000616261 1167 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.968e-8■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 KANK1-201ENST00000354485 6912 ntTSL 28.13□□□□□ -1.112e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-207ENST00000553524 707 ntTSL 319.73■□□□□ 0.752e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-214ENST00000554331 831 ntTSL 217.03■□□□□ 0.322e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-239ENST00000557239 471 ntTSL 416.84■□□□□ 0.292e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-243ENST00000557722 848 ntTSL 516.11■□□□□ 0.172e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-222ENST00000555063 573 ntTSL 214.79□□□□□ -0.042e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-229ENST00000556435 528 ntTSL 213.05□□□□□ -0.322e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-230ENST00000556504 847 ntTSL 510.26□□□□□ -0.772e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-228ENST00000556338 547 ntTSL 410.26□□□□□ -0.772e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-235ENST00000556698 640 ntTSL 410.26□□□□□ -0.772e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.842e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.892e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 CREB3L2-205ENST00000458726 776 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.962e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-211ENST00000553808 1060 ntTSL 28.83□□□□□ -12e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-240ENST00000557297 821 ntTSL 36.24□□□□□ -1.412e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 CREB3L2-202ENST00000420629 719 ntTSL 36.09□□□□□ -1.432e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-213ENST00000554084 866 ntTSL 55.68□□□□□ -1.52e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-223ENST00000555410 677 ntTSL 54.76□□□□□ -1.652e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 WARS-205ENST00000553395 801 ntTSL 54.71□□□□□ -1.662e-7■■□□□ 13.5
ILF3Q12906 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PPP1R37-206ENST00000544069 712 ntTSL 523.38■■□□□ 1.337e-9■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.27e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.937e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.767e-8■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PPP1R37-203ENST00000496125 555 ntTSL 317.5■□□□□ 0.397e-9■■□□□ 13.4
ILF3Q12906 PSMD12-204ENST00000578015 448 ntTSL 216.68■□□□□ 0.261e-6■■□□□ 13.4
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 96.8 ms