Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMA1Q12791 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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KCNMA1Q12791 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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KCNMA1Q12791 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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KCNMA1Q12791 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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KCNMA1Q12791 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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KCNMA1Q12791 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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KCNMA1Q12791 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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KCNMA1Q12791 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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KCNMA1Q12791 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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KCNMA1Q12791 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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KCNMA1Q12791 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMA1Q12791 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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