Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms