Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCBP1Q09161 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms