Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms