Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR3Q06889 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR3Q06889 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms