Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LTBQ06643 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LTBQ06643 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LTBQ06643 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LTBQ06643 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms