Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAD51Q06609 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAD51Q06609 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms