Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPN11Q06124 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms