Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHRNB3Q05901 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNB3Q05901 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms