Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALD1Q05682 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms