Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TLE4Q04727 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms