Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH2Q04721 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms