Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GBE1Q04446 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms