Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms