Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms