Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXO4P98177 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms