Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPD2P62316 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPD2P62316 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms