Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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