Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN2P57739 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms