Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSWP56202 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSWP56202 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSWP56202 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTSWP56202 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSWP56202 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSWP56202 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSWP56202 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms