Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms