Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SUMO3P55854 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms