Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP9P55211 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP9P55211 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP9P55211 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms