Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP12AP54707 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms