Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
YARSP54577 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
YARSP54577 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YARSP54577 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YARSP54577 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YARSP54577 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YARSP54577 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YARSP54577 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
YARSP54577 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YARSP54577 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
YARSP54577 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
YARSP54577 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
YARSP54577 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
YARSP54577 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
YARSP54577 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms