Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB3P54284 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms