Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKX2-5P52952 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms