Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB28P51157 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB28P51157 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB28P51157 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB28P51157 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB28P51157 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB28P51157 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB28P51157 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB28P51157 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB28P51157 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB28P51157 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB28P51157 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB28P51157 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB28P51157 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB28P51157 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms