Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RAB5CP51148 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB5CP51148 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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