Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXA1P49639 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms