Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK8P49336 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK8P49336 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK8P49336 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK8P49336 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK8P49336 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK8P49336 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK8P49336 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK8P49336 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK8P49336 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms