Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A3P48751 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A3P48751 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms