Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX5P48382 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX5P48382 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX5P48382 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX5P48382 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX5P48382 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX5P48382 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFX5P48382 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFX5P48382 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX5P48382 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX5P48382 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX5P48382 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX5P48382 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms