Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAPZBP47756 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPZBP47756 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms