Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCR1P46094 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCR1P46094 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCR1P46094 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCR1P46094 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCR1P46094 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCR1P46094 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCR1P46094 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCR1P46094 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
XCR1P46094 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
XCR1P46094 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
XCR1P46094 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCR1P46094 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCR1P46094 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCR1P46094 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCR1P46094 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCR1P46094 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCR1P46094 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
XCR1P46094 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
XCR1P46094 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCR1P46094 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
XCR1P46094 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms